F1 종자는 서로 다른 두 품종인 모본과 부본을 교배시켜 만든다. 모본이 자기 수술의 꽃가루로 수정되면 원하는 잡종이 아닌 모본과 같은 순종 종자가 만들어지고, 이는 F1 종자의 순도를 떨어뜨린다. 그래서 인공수분 전에 모본 꽃의 수술을 미리 제거하는 제웅을 한다. 제웅은 모본의 자가 수분을 차단하여 부본 화분과의 교배 순도를 확보하기 위해 수행한다. 작업능률을 높이기 위한 것이 아니고, 잡종강세는 교배 결과 나타나는 현상이며, 다습에 의한 병해방지는 봉지 씌우기 등 다른 관리와 관련된다.
자가불화합성 작물은 같은 계통의 꽃가루로 수정이 되지 않는다. 이 특성을 이용해 1대잡종을 채종할 때 원종을 얻으려면 자가수정을 인위적으로 유도해야 한다. 꽃봉오리 상태에서 수술을 제거하고 자신의 꽃가루를 묻히는 뇌수분이나 이산화탄소 처리로 자가불화합성을 일시적으로 억제하는 방법을 쓴다. 개화 후의 개화수분은 자가수분 차단이 불가능해 원종 채종에 적합하지 않다. 자가불화합성 계통의 채종에서는 뇌수분 시기에 인공수분을 하는 조합이 알맞다.
인공수분 시 다른 꽃가루가 섞이지 않도록 격리법을 쓴다. 웅화·웅예제거법, 화판제거법, 거리격리법이 격리법의 종류다. 춘화처리법은 추운 온도에 노출시켜 개화를 유도하는 생리적 처리 방법으로, 꽃가루 섞임을 막는 격리법이 아니다.
개화 전날 화분친으로 쓸 숫꽃에도 봉지를 씌운다. 꽃이 피기 전에 외부의 다른 꽃가루가 붙는 것을 막아 화분오염을 방지하기 위해서다. 개화기 조절이나 화분 활력 유지, 마르는 것 방지가 주된 목적은 아니다. 봉지씌우기는 인공수분을 통한 F1 채종에서 가장 필수적이다. 고정종 채종은 자연수분이나 자가수분이 주를 이루어 봉지씌우기가 선택적이고, 웅성불임성이나 자가불화합성을 이용하는 방법은 자가수분 장벽이 이미 있어 봉지 필요성이 상대적으로 낮다.
품종의 유전적 순도를 높이는 방법은 교잡을 막는 데 있다. 인공수분은 원하는 꽃가루만 사용해 교잡을 통제하고, 격리재배는 다른 품종과 거리를 두어 자연 교잡을 막고, 개화 전 이형주 제거는 원하지 않는 형질을 가진 식물을 미리 뺀다. 염수선은 종자의 밀도 차이를 이용해 형태적으로 좋은 종자만 선별하는 방법이므로 유전적 순도를 직접 높이는 방법과는 거리가 멀다.
세포질 유전자적 웅성불임을 활용해 F1 종자를 생산할 때는 각 계통이 지닌 세포질과 임성회복 유전자의 조합이 관건이 된다. 화분친은 정상 세포질과 우성 회복 유전자를, 종자친은 불임 세포질과 열성 유전자를 가지는 조합이 설계의 기본이 된다.